В Татьянин день в 1755 году императрица Елизавета Петровна подписала указ об основании Московского университета, вот почему именно святая Татиана считается покровительницей университета и его студентов.
Первый домовой храм сгорел вместе со зданием университета в пожаре 1812 года. Нынешний располагается во флигеле Пашковской усадьбы, который в 1836 году архитектор Д.Тюрин безвозмедно перестроил под храм. На фронтоне здания тогда появилась надпись «Свет Христов просвещает всех» (восстановлена уже в наши дни). В 1837 году святитель Филарет освятил новую Татиановскую церковь.
До революции прихожанами церкви были сотрудники университета, известные деятели искусств. Среди них и дочери профессора Ивана Цветаева – Марина и Анастасия. Под сводами храма прошла их первая исповедь и состоялось первое причастие. В церкви отпевали В.О.Ключевского, А.А.Фета, М.П. Погодина и Н.В.Гоголя.
В 1918 году храм закрыли, в советское время его превратили в клуб МГУ. 25 января 1995 года домовая церковь Московского университета была вновь освящена. Позднее на первом этаже был устроен придел во имя святителя Филарета, митрополита Московского, когда-то освящавшего саму Татианинскую церковь.